Décrypthon 2

Non. Le programme téléchargé du Décrypthon fait appel à la capacité de calcul non-utilisée par l’utilisateur, selon le principe du « grid computing » ou calcul en grille. Ce programme de calcul travaillant en tâche de fond, nécessite certes d’avoir l’ordinateur allumé pour pouvoir être actif. Mais il ne monopolise pas celui-ci, que vous pourrez continuer à utiliser pour vos besoins courants (surf sur Internet, traitement de texte etc).

Serons-nous tenus informés des résultats du Décrypthon ? :

Absolument. Il est même prévu dans le cadre de Décrypthon, une rubrique spécialisée sur le site http://www.telethon.fr qui tiendra informée non seulement des résultats, mais des avancées réalisées par les équipes de recherches participant au programme.

Comment les projets scientifiques sont-ils sélectionnés ?

Un premier appel à projets a été fait à la demande de l’AFM pour initialiser le programme de réflexion et de coopération scientifique. Par la suite, différents appels à projets seront renouvelés de façon plus formelle de façon à inciter davantage de scientifiques à s’intéresser au programme et à pouvoir utiliser « à la demande » la grille de calcul nationale du Décrypthon.

Le programme Décrypthon est un bel exemple de coopération nationale et bientôt internationale, car d’autres pays (dont la Belgique en premier lieu...) sont appelés à y participer prochainement. Il permet de partager l’excédent de puissance informatique non utilisée à un instant donné, pour la mettre à disposition d’un programme de recherche ambitieux, altruiste et piloté « à la demande » par des personnes malades ou des familles de malades. Il offre aussi l’occasion de s’affranchir des barrières technologiques, des lenteurs administratives ou des clivages privé/public, pour unir dans un même effort de générosité, les capacités de tous pour accélérer la recherche de nouvelles thérapies.

Qui sont les partenaires du Décrypthon ? :

Le programme Décrypthon découle d’un accord de partenariat entre l’AFM., le CNRS et IBM, et particulièrement sa Division Sciences du vivant.

Est-ce qu’à terme plusieurs projets scientifiques tourneront en même temps sur mon ordinateur grâce à la plate-forme Décrypthon ?

Oui. Le programme Décrython est conçu comme un programme de recherche « à la demande » sur 3 ans. Il va donc évoluer dans le temps, avec différents modules de calcul. L’utilisateur pourra donc, s’il le désire, suivre cette évolution du Décrypthon en téléchargeant les nouveaux modules sur le site Internet spécialisé, au fur et à mesure de leur mise à disposition.

Le programme Décrypthon découle d’un accord de partenariat entre l’Association Française contre les Myopathies, le CNRS. et IBM, et particulièrement sa Division Sciences du vivant. Chacun des partenaires prend en charge une partie des coûts de l’opération, soit en contribution financière ou son équivalent en moyens techniques et humains mis à disposition pour ce programme.

Est-ce que les résultats seront mis gratuitement à disposition de la communauté scientifique mondiale ?

Oui. De plus, les chercheurs et les scientifiques participant au programme Décrypthon communiqueront les résultats de leurs travaux, par le moyen de publications scientifiques officielles, soumises à un Comité de lecture, contrôlant leur qualité et augmentant leur diffusion sur le plan international.

Quel intérêt de solliciter les internautes alors que vous avez des partenariats avec des centres de calculs universitaires ?

Les programmes de calcul qui seront répartis sur la grille nationale, ne seront pas les mêmes selon qu’il s’agira d’un super-calculateur universitaire sous UNIX, ou d’un PC individuel sous Windows. Ces tâches de calcul différentes seront fédérées et équilibrées par un super-calculateur central fourni par IBM Sciences du Vivant. La contribution d’un grand nombre d’internautes est donc essentielle, pour pouvoir utiliser au mieux les centres de calcul universitaires et devrait permettre de faire en 1 an, ce qui aurait sinon, nécessité 2 ans de calculs.

Je suis responsable informatique de ma société, comment puis-je déployer l’application Décrypthon sur tous les ordinateurs de ma société ?

Il n’y a pas de problème si les ordinateurs de la société sont reliés individuellement à Internet. S’ils sont connectés en réseau local, raccordé à Internet par l’intermédiaire d’un pare-feu en tête de réseau, dans ce dernier cas, le pare-feu en tête de réseau peut créer dans certains cas un obstacle. Contacter le support technique sur le site internet Téléthon, pour la conduite à tenir au cas par cas.

questions techniques

Pourront se connecter les ordinateurs individuels de type PC, reliés individuellement à Internet (modem téléphonique, câble, ADSL, satellite...), utilisant le système d’exploitation Microsoft Windows 98 deuxième édition et au-delà, ainsi que LINUX. Le support de Mac est en cours d’étude.

Quels sont les ordinateurs qui pourront utiliser l’application ? :

Décrypthon fera appel à 2 types d’ordinateurs : soit des super-calculateurs sous UNIX tels que ceux utilisés par les Centres de calcul universitaires participant à l’opération, soit des milliers d’ordinateurs individuels de type PC, reliés individuellement à Internet.

Est-ce que j’aurais des informations sur les caluls en cours et réalisés grâce à ordinateur ?

Il sera possible de connaître l’avancement des travaux et de suivre les indicateurs sur la contribution effective des participants. Le détail de ces informations sera expliqué sur le site Téléthon lors du démarrage de la phase CALCUL.

Comment installer l’application Décrypthon sur mon ordinateur ? :

Il sera possible de télécharger le programme de calcul sur son ordinateur depuis Internet ou bien à partir de CD-ROM qui seront fournis par des partenaires de l’opération.

Non. Le logiciel téléchargé pour le Décrypthon I était dédié à la comparaison de séquences de protéines et ce travail de décryptage est achevé depuis mai 2002. Les résultats ont été mis à la disposition de la communauté des chercheurs sur un site Internet dédié. Le nouveau projet Décrypthon fera appel à des tranches de calcul beaucoup plus sophistiquées, menées en parallèle, qui nécessite des programmes spécifiques nouveaux à télécharger.

Y a t-il des risques de propagation d’un virus pour mon ordinateur ? :

Il est conseillé d’être équipé d’un anti-virus à jour et d’un pare-feu personnel sur son ordinateur, pour toute connexion à Internet. Le logiciel Décrypthon est certifié sans virus connu à ce jour.

Comment pourrais-je savoir si le logiciel que je téléchargerai sera sans virus ? :

Les programmes mis à disposition par téléchargement ou sur CD-ROM seront garantis sans virus connus. L’utilisateur pourra toujours lancer une vérification avec son anti-virus.

Dois-je laisser mon ordinateur allumé tout le temps ? :

Non. Le programme téléchargé du Décrypthon fait appel à la capacité de calcul non-utilisée par l’utilisateur, selon le principe du « grid computing » ou calcul en grille. Ce programme de calcul travaillant en tâche de fond, nécessite certes d’avoir l’ordinateur allumé pour pouvoir être actif. Mais il ne monopolise pas celui-ci, que vous pourrez continuer à utiliser pour vos besoins courants surf sur Internet, traitement de texte etc. Qui dois-je contacter en cas de problème technique ? :

Un support technique sera disponible sur le site Internet http://www.telethon.fr

Où puis-je consulter les résultats des calculs de mon ordinateur ? :

Il est prévu dans le cadre de Décrypthon, une rubrique spécialisée sur le site Téléthon qui tiendra informée non seulement des résultats, mais des avancées réalisées par les équipes de recherches participant au programme.

Est-ce qu’à terme plusieurs projets scientifiques tourneront en même temps sur mon ordinateur grâce à la plate-forme Décrypthon ?

Oui. Le programme Décrython est conçu comme un programme de recherche « à la demande » sur 3 ans. Il va donc évoluer dans le temps, avec différents modules de calcul. L’utilisateur pourra donc, s’il le désire, suivre cette évolution du Décrypthon en téléchargeant les nouveaux modules sur le site Internet spécialisé, au fur et à mesure de leur mise à disposition.

Est-ce que l’application Décrypthon risque de faire "planter" mon ordinateur ?

Le maximum de soin sera apporté à la stabilité du programme. Suivant les autres programmes ou tâches lancées par l’utilisateur sur son ordinateur, un « plantage » peut toujours se produire. Cela est inhérent au système d’exploitation utilisé. Par contre, le programme du Décrypthon ne pourra causer lui-même, aucun dommage à l’ordinateur utilisé.

Puis-je continuer à travailler sur mon ordinateur pendant que les calculs sont en cours ?

Oui. Le programme de calcul du Décrypthon travaille en tâche de fond. Il nécessite d’avoir l’ordinateur allumé pour pouvoir être actif. Mais il ne monopolise pas celui-ci, que vous pourrez continuer à utiliser pour vos besoins courants ; surf sur Internet, traitement de texte etc.

Oui. Pourront se connecter les ordinateurs individuels de type PC, reliés individuellement à Internet (modem téléphonique, câble, ADSL, satellite...), utilisant le système d’exploitation Microsoft Windows 98 Millénium édition et au-delà ainsi que LINUX. Le support de Mac est en cours d’étude. Il sera possible de télécharger le programme de calcul sur son ordinateur depuis Internet ou bien à partir de CD-ROM qui seront fournis par des partenaires de l’opération.

Je participe déjà à d’autres opérations de calculs partagés actuellement, puis-je participer en même temps au projet Décrypthon ?

Oui, en théorie il n’y a aucune incompatibilité. Il faut cependant tenir compte du fait, qu’il n’est pas conseillé de faire fonctionner simultanément deux programmes reposant sur le principe d’une grille de calcul, car le but est précisément d’exploiter le plus possible la puissance de calcul inutilisée de l’ordinateur.

Je veux arrêter mon ordinateur en cours de calculs, puis-je le faire sans problème ?

Oui, à condition de le faire comme prévu par le système d’exploitation utilisé, en terminant les tâches en cours et non pas en éteignant brutalement l’ordinateur. Cette recommandation est indépendante du Décrypthon et s’applique à tout utilisateur de PC.

Mon ordinateur a planté, au prochain redémarrage reprendra t-il automatiquement le dernier calcul en cours ?

Oui, en ce qui concerne le programme du Décrypthon. Cependant, si le « plantage » a été provoqué par d’autres programmes utilisés en parallèle, il est possible que des anomalies surviennent au re-démarrage. Cela ne sera pas dû au Décrypthon, mais dépendra de la nature du problème survenu avec les autres programmes utilisés ayant provoqué le plantage.

Questions scientifiques

Est-ce que les résultats seront mis gratuitement à disposition de la communauté scientifique mondiale ?

Oui. De plus, les chercheurs et les scientifiques participant au programme Décrypthon communiqueront les résultats de leurs travaux, par le moyen de publications scientifiques officielles, soumises à un Comité de lecture, contrôlant leur qualité et augmentant leur diffusion sur le plan international.

A quoi sert Décrypthon ?

Le programme Décrypthon consiste à mettre en place un réseau de calcul collaboratif national, appelé « grille », pour permettre à des équipes de chercheurs scientifiques de haut niveau, partenaires de l’AFM, de bénéficier d’une puissance informatique décuplée. Celle-ci va leur permettre de modéliser « à la demande » des molécules de protéines en 3 dimensions, impliquées dans les maladies que combat l’AFM, puis de caractériser leurs fonctions et de simuler leurs interactions. Décrypthon II vise à accélérer ainsi, la recherche de nouvelles voies thérapeutiques pour beaucoup de maladies.

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Un Conseil scientifique de haut niveau, constitué sous le parrainage du Dr Dino Moras, chercheur de renom international, membre de l’Académie des Sciences et qui regroupe des chercheurs du CNRS et de l’AFM. Il s’appuie ensuite, sur un Comité scientifique, chargé d’harmoniser en terme de cahier des charges et de faisabilité, les projets retenus.

Est-ce qu’à terme plusieurs projets scientifiques tourneront en même temps sur mon ordinateur grâce à la plate-forme Décrypthon ?

Oui. Le programme Décrython est conçu comme un programme de recherche « à la demande » sur 3 ans. Il va donc évoluer dans le temps, avec différents modules de calcul. L’utilisateur pourra donc, s’il le désire, suivre cette évolution du Décrypthon en téléchargeant les nouveaux modules sur le site Internet spécialisé, au fur et à mesure de leur mise à disposition.

Un premier appel à projets a été fait à la demande de l’AFM pour initialiser le programme de réflexion et de coopération scientifique. Par la suite, différents appels à projets seront renouvelés de façon plus formelle de façon à inciter davantage de scientifiques à s’intéresser au programme et à pouvoir utiliser « à la demande » la grille de calcul nationale du Décrypthon.

Est-ce que les résultats du premier Décrypthon seront utilisés pour ce nouveau projet Décrypthon ?

Pas directement. Les problèmes auxquels s’attaque le Décrypthon sont beaucoup plus complexes. Cependant, pour rechercher de nouvelles voies thérapeutiques, les résultats obtenus par le premier projet Décrypthon, sont déjà utiles à certaines équipes de chercheurs dans leur travail.